این موزه در یکی از بناهای تاریخی مربوط به دوره قاجار با عنوان عمارت بدیع الحکما و به مساحت ۲هزار متر مربع در مالکیت دانشگاه علوم پزشکی همدان واقع شده است. در این موزه به معرفی مشاهیر شاخص استان همدان در حوزه پزشکی پرداخته شده و اسناد و نسخ خطی پزشکی در ادوار مختلف به‌همراه تجهیزات و ادوات پزشکی به نمایش درآمده است.