قدمت بنای چشم نواز مسجد مقبره به دوره صفوی می رسد و در دل خود 9 ستون سنگی زیبا را جای داده است.بعد از زلزله سال 1193 هجری قمری و فروریختن سقف مسجد، مرحوم میرزا مهدی قاضی طباطبایی مرمت آن را عهده دار شد و از آن جایی که مقبره خود او نیز در همان جا قرار دارد، این مسجد به نام مسجد مقبره نیز شناخته می شود. بقعه آیت الله شهید سید محمدعلی طباطبایی نیز در همین مکان واقع است. امروزه مسجد مقبره با گنبدهای بلند و ضربی زیبایش در خیابان دارایی اول بازار کفاشان واقع شده است و قبلا با نام مسجد شاه نیز شناخته می شد.مسجد مقبره به عنوان یكی از مساجد مهم و بزرگ بازار تاریخی و مسقف تبریز، مامن و خاستگاه حركت های انقلابی دهه های 1340 و 1350 شمسی بوده است.  این اثر، در تاریخ ۱۰ مهر ۱۳۸۰، با شماره ثبت ۴۱۹۵، به عنوان یکی از آثار ملی ایران، به ثبت رسیده است.