کویر قوم تپه حاصل هزاران سال تلاش زمین و حرکت باد و خاک است که در نهایت در قالب تپه های ماسه ای و یک نمکزار کوچک کویر قوم تپه را تشکیل داده اند. قرار گرفتن قوم تپه در مسیر بادها و وزش مداوم آن­ها سبب شده تا ذرات درشتر خاک باقی ماند و ذرات ریزتر در هوا جا به جا شوند، حاصل این غربالگری کاملا طبیعی پدید آمدن تپه های ماسه ای زیبا و کوچکی است که کویر کوچک و بسیار زیبای قوم تپه را تشکیل می دهند. وزش باد باعث جابه جا شد تپه های ماسه ای و تغییر شکل مداوم آن ها نیز می شود که در نوع خود بسیار جذاب است. به همین دلیل این منطقه از جمله جذابترین جاذبه های طبیعی شبستر به شمار می رود. گاهی تپه های ماسه ای به سمت روستای قوم تپه حرکت کرده و گاهی دامن پس کشیده و از آن فاصله می گیرند.